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Centro de Modelamiento Matemático - CMM

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Investigadores del CMM comparten su experiencia en proyectos metagenómicos

  • Estudiantes de doctorado, ligados a la biología y biotecnología de distintas universidad del país participaron en el “Taller de Herramientas Bioinformáticas para el análisis masivo de datos metabolómicos”, una actividad organizada por el Centro de Modelamiento Matemático (CMM) en conjunto con el Centro de Regulación del Genoma (CRG) y BioSigma SA.

A través de cinco clases teóricas y cuatro prácticas, los asistentes conocieron las distintas etapas de la metabolómica y las herramientas informáticas y matemáticas que se utilizan para resolver distintos problemas que pudieran aparecer en el estudio de comunidades en sus ambientes naturales a través de modernas técnicas de biología molecular, también llamado análisis metagenómico.

"El objetivo de este taller es transferir la experiencia desarrollada por Mathomics del CMM-CRG (ver recuadro) en el análisis bioinformático de datos masivos provenientes de experimentos metagenómicos, muchos de los cuales se han llevado a cabo en BioSigma, que gracias a un proyecto INNOVA-CORFO ha instalado en Chile una plataforma metabolómica de última generación", explica Alejandro Maass, investigador asociado del CMM y CRG.

El académico advierte que actividades como ésta ayudan a la débil formación que existe en Chile sobre estos temas desde el punto de vista bioinformático. "Esperamos que este taller permita a distintos centros de investigación, empresas biotecnológicas, hospitales, etc., realizar experimentos de medición y cuantificación de metabolitos en Chile. El compartir nuestra experiencia, permite que una comunidad más amplia conozca sobre estos temas y se beneficie con estas técnicas" añade.

El taller, que comenzó el 26 de septiembre y concluye este viernes también contempló una visita a las instalaciones de BioSigma en Colina.

Dada la alta demanda que tuvo esta actividad, sus organizadores han pensado en realizar una segunda versión, esta vez orientada a alumnos de pregrado, quienes por razones de espacio no pudieron participar.


Mathomics es una plataforma de colaboración del Centro de Modelamiento Matemático y el Centro para la Regulación del Genoma de la Universidad de Chile, creado para apoyar proyectos biotecnológicos desde la perspectiva bioinformática y del modelamiento matemático, y de esta forma enfrentar los problemas desde un punto de vista de la Biología de Sistemas.

Su trabajo se constituye formando alianzas estratégicas con universidades, centros de investigación y empresas públicas y privadas con el propósito de desarrollar proyectos en conjunto.


Mathomics nace del Laboratorio de Bioinformática y Matemática del Genoma del CMM y sus actividades bioinformáticas de apoyo a proyectos en biominería en asociación con la compañía BioSigma S.A. y de un proyecto Fondef.

www.mathomics.cl


 
Autor : Comunicaciones CMM
Fecha : 03-10-2011

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